埃博拉能感染神经元并持续释放病毒120天,鱼类癌症还能跨鱼传染
脑类器官显示埃博拉可感染神经元并持续释放感染性病毒达120天;褐牛头鲶群中的黑色素瘤来自单克隆祖先并跨鱼传播。病毒长存与传染性癌症的边界被同时改写。
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三档评分给政治任命更大的挑项目空间
NIH 提议把基金评审的数字评分改成「好、中、差」三档,理由是当前数字被严重压缩,大量基金分数挤在一起,区分度很低;三档制已在 NSF 使用。Rich 并不反对分档本身,但他说真正的问题是他们三个人现在都不信任 NIH 的高层:模糊档位会让政治任命官员更容易按意识形态挑项目。他还回忆 NSF 当年在他首笔基金被拒后仍给了部分资助。
— Rich Condit测到RNA不算持续感染,要看放不放病毒
汉堡伯恩哈德·诺赫特研究所团队用人脑类器官研究埃博拉的长期存在,并区分了两类 persistence:productive persistence 是持续释放传染性颗粒;nonproductive persistence 是只能测到 RNA。microglia 在 MOI 1 或 10 条件下传代 13 次仍持续感染 91 天;整个类器官的感染比例超过 90%,持续产生病毒达 120 天。定义清楚后,「持续感染」就不能再被 RT-PCR 阳性一句话带过,必须证明有完整病毒释放。
— Alan Dove埃博拉能直接感染神经元,此前从没报道过
研究团队在类器官里观察感染扩散:病毒从类器官外周向中心推进,感染神经元、星形胶质细胞和 microglia。神经元感染此前从未被报道,这改写了过去「埃博拉不嗜神经」的认知。被感染的细胞周围出现 microglia 聚集,提示固有免疫在尝试应答;Lassa 病毒作为对照,48 天内就从类器官消失,而埃博拉仍然存在。差异提示病毒在大脑中的复制不是偶然污染。
— Alan Dove免疫既进攻又刹车,反而方便病毒久留
感染类器官的并不只有毁灭性炎症。研究人员在被感染的脑类器官里同时检出促炎细胞因子、趋化因子和抗炎介质。这说明宿主的炎症应答是一个自我平衡的系统,有进攻、也有刹车。对病毒持续存在来说,一个被适度抑制的免疫环境比「一边倒的炎症风暴」更有利于长期共存。
类器官里的突变,幸存者身上从没见过
作者坦承模型隔离于体内环境,缺乏血脑屏障等对免疫豁免状态的贡献;更关键的是,类器官里出现的单核苷酸变异从未在埃博拉病毒病幸存者身上报道过,说明两者有根本差异。许多突变被认为会降低或阻止病毒复制,低水平复制反而可能让病毒在细胞群中维持存在。持续感染未必靠高滴度,也可能靠「低到不触发清除」的复制维持。
污染不是元凶,这种癌症会在鱼之间传染
2012年起,Memphremagog 湖(缅因州与魁北克之间)的渔民不断捕到带黑色隆起病变的褐牛头鲶(Amiurus nebulosus),组织学鉴定为恶性黑色素瘤。2014–2017 年间取样,23%–37% 的鱼带病变。最初人们怀疑 2011 年热带风暴 Irene 带来的径流污染是诱因,可后续数据把矛头指向了更罕见的方向——肿瘤本身能在鱼群之间传染。这个湖成了观察「癌症如何成为病原体」的天然现场。
湖里的肿瘤同源一个克隆,还是外来的
两项基因组分析相互印证。线粒体基因组树上,所有肿瘤样本构成一个单系群,意味着它们来自单一祖先;而肿瘤序列与同一只鱼的正常组织、湖中其他鱼的正常组织都不相似,正常组织的序列在树上分散分布。核基因组的单核苷酸变异分析同样得到单系群,并且这些肿瘤基因组与新罕布什尔州和缅因州未受影响的参考鱼更接近,而不是湖里的其他鱼——所以引发传染的克隆并非起源于该湖,而是从其他地方传入。
人类癌突变各不相同,鱼癌里过半被共享
更硬的证据来自变异共享统计。16 对肿瘤与正常组织中共识别出 245,000 个肿瘤特异性 SNV 和 61,000 个脑特异性 SNV;肿瘤特异性 SNV 里 59% 被至少 14 条鱼共享,而脑组织特异性 SNV 里 83% 只在一条鱼里出现。作为参照,人类黑色素瘤数据库中 94% 的 SNV 是单个癌症特有的,只有 0.008% 被超过 10 个癌症共享。鱼肿瘤里如此高比例的共享变异,论文作者认为进一步支持这些癌来自同一克隆并具有传染性。
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I think the worst part, the tragic part about all this is that three of us are sitting here saying we don't trust the people at NIH. Yes. That's a tragedy.
我认为最糟糕、最悲剧的部分是,我们三个人坐在这里说我们不信任 NIH 的人。是的,这是悲剧。
Rich Condit16:26
So they draw this distinction here between two kinds of persistence, productive persistence, which is, yeah, there's infectious particles, and nonproductive persistence, which is RNA only.
所以他们在这里区分了两种持续性:生产性持续是存在传染性颗粒,非生产性持续则只有 RNA。
Vincent Racaniello25:43
The barrier is immune recognition. You know, we have really good MHC systems who are outbred. And so any transplanted cells get rejected.
屏障是免疫识别。我们有非常好的 MHC 系统,因为我们是异系繁殖(outbred),所以任何被移植的细胞都会被排斥。
the rarity of transmissible cancers suggests evolutionary selection against them. But she said maybe we're not looking hard enough.
传染性癌症的稀缺表明进化选择对它们不利。但她说也许我们找得还不够仔细。
I don't know why you needed to make these pencil things. I guess because you could, right?
我不知道为什么有人要造这些铅笔似的东西。大概是因为他们能吧,对吧?
Vincent Racaniello1:35:29
It's not just capitalist. It's too capitalist. We've taken things a little too far these days.
这不只是资本主义,这是过度资本主义。如今我们有点走得太远了。
Rich Condit1:37:36
数字与实体
| NIH 新评审档位数 | 3 | 8:13 |
| 小胶质细胞持续感染天数 | 91 天 | 31:49 |
| 脑类器官感染比例 | 90% 以上 | 38:56 |
| 脑类器官持续产生病毒天数 | 120 天 | 38:56 |
| Memphremagog 湖鲶鱼病变率 | 23%–37% | 52:18 |
| 肿瘤特异性 SNV 总数 | 245,000 | 1:03:54 |
| 人类黑色素瘤中单个癌症独有的 SNV 占比 | 94% | 1:04:54 |
| 被 10 个以上癌症共享的人类黑色素瘤 SNV 占比 | 0.008% | 1:04:54 |
| 铅笔楼公寓售价 | 1500 万美元/套 | 1:35:29 |
| 倾斜铅笔楼拆除费用估算 | 1.5 亿美元 | 1:35:29 |
术语
- productive persistence生产性持续感染
- 持续释放具有传染性的病毒颗粒,而不是只残留核酸。
- nonproductive persistence非生产性持续感染
- 能检出病毒RNA但不再释放传染性颗粒的状态。
- BSL-4生物安全四级实验室
- 处理最危险病原体的最高等级防护设施。
- MOI感染复数
- 病毒感染细胞时加入的病毒颗粒数与细胞数的比值。
收听指南
病毒学与神经感染研究者、研究可传播肿瘤的癌症生物学家,以及关心 NIH 基金生态和生物安全政策的科研管理者。
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